A tractable Bayesian joint model for longitudinal and survival data

We introduce a numerically tractable formulation of Bayesian joint models for longitudinal and survival data. The longitudinal process is modeled using generalized linear mixed models, while the survival process is modeled using a parametric general hazard structure. The two processes are linked by sharing fixed and random effects, separating the effects that play a role at the time scale from those that affect the hazard scale. This strategy allows for the inclusion of nonlinear and time-dependent effects while avoiding the need for numerical integration, which facilitates the implementation of the proposed joint model. We explore the use of flexible parametric distributions for modeling the baseline hazard function which can capture the basic shapes of interest in practice. We discuss prior elicitation based on the interpretation of the parameters. We present an extensive simulation study, where we analyze the inferential properties of the proposed models, and illustrate the trade-off between flexibility, sample size, and censoring. We also apply our proposal to two real data applications in order to demonstrate the adaptability of our formulation both in univariate time-to-event data and in a competing risks framework. The methodology is implemented in rstan

Reducing the parameter space for Unparticle-inspired models using white dwarf masses

Based on astrophysical constraints derived from Chandrasekhar's mass limit for white-dwarfs, we study the effects of the model on the parameters of unparticle-inspired gravity, on scales $\Lambda_U > 1 \; TeV$ and $d_U \approx 1$.Comment: 4 pp., 4 Fig., to appear in PR

On the connection of Gamma-rays, Dark Matter and Higgs searches at LHC

Motivated by the upcoming Higgs analyzes we investigate the importance of the complementarity of the Higgs boson chase on the low mass WIMP search in direct detection experiments and the gamma-ray emission from the Galactic Center measured by the Fermi-LAT telescope in the context of the $SU(3)_c\otimes SU(3)_L\otimes U(1)_N$. We obtain the relic abundance, thermal cross section, the WIMP-nucleon cross section in the low mass regime and network them with the branching ratios of the Higgs boson in the model. We conclude that the Higgs boson search has a profound connection to the dark matter problem in our model, in particular for the case that ($M_{WIMP} < 60$ GeV) the BR($H \rightarrow 2$ WIMPs) $\gtrsim 90$. This scenario could explain this plateau of any mild excess regarding the Higgs search as well as explain the gamma-ray emission from the galactic center through the $b\bar{b}$ channel with a WIMP in the mass range of 25-45 GeV, while still being consistent with the current limits from XENON100 and CDMSII. However, if the recent modest excesses measured at LHC and TEVATRON are confirmed and consistent with a standard model Higgs boson this would imply that $M_{WIMP} > 60$ GeV, consequently ruling out any attempt to explain the Fermi-LAT observations.Comment: 8 pages, 9 figure

Micotoxinas em amêndoas da castanheira-do-brasil.

Durante a palestra serão discutidos os problemas inerentes à presença de aflatoxinas na cadeia produtiva de castanha-do-brasil, os resultados obtidos durante o desenvolvimento do projeto e seu potencial impacto para a melhoria da qualidade deste produto

Micotoxinas em amêndoas da castanheira-do-brasil.

Durante a palestra serão discutidos os problemas inerentes à presença de aflatoxinas na cadeia produtiva de castanha-do-brasil, os resultados obtidos durante o desenvolvimento do projeto e seu potencial impacto para a melhoria da qualidade deste produto

Distribuição espacial do escoamento da produção de farinha de mandioca no terrirório do Vale do Juruá, Acre.

O Território da Cidadania do Vale do Juruá (TCVJ) é uma das cinco regiões em que o Estado do Acre está dividido, composto pelos municípios de Cruzeiro do Sul, Marechal Thaumathurgo, Mâncio Lima, Porto Walter e Rodrigues Alves. Nesta região, a produção de farinha de mandioca é uma tradição apreciada em todo estado e conhecida pela forma artesanal de fabricação. De acordo com a Secretaria da Fazenda do Estado do Acre, em 2009, foram produzidas em Cruzeiro do Sul aproximadamente 4.366 toneladas deste produto e suas características físico-químicas se enquadram nos padrões da legislação brasileira (SOUZA et. al, 2008). O Sistema de Informação Geográfica ? SIG é uma tecnologia computacional composta pelos subsistemas de entrada, processamento e saída de dados com localização geográfica conhecida (MIRANDA, 2005). Além da percepção visual da distribuição espacial de eventos, o SIG é muito útil para traduzir padrões existentes com considerações objetivas e mensuráveis (DRUNK et.al., 2004). Desta forma, este sistema de informação pode ser útil para identificar os padrões de proximidade e tendências de agrupamento de casa de farinha e apresentação visual dos atributos para a forma de escoamento da produção. Em virtude da qualidade e importância socioeconômica, cultural e agrícola da farinha de mandioca do TCVJ, este trabalho teve como objetivo identificar espacialmente o padrão de escoamento da produção de farinha de mandioca no Território da Cidadania do Vale do Juruá, Acre. Este último pertence a outra divisão territorial do Acre (Tarauacá-Envira), porém teve o oeste de sua área incluída neste trabalho pela proximidade com o Juruá.Categoria Processamento e agroindústria: resumo 181

COMPARAISON DES PRECIPITATIONS PENDANT LA PERIODE DE CULTURE DE SOJA DANS DEUX REGIONS AU BRESIL

International audienceThis paper aims to compare the recent rainfall variability during the soybean cultivation month between 1998-1999 and 2012-2013 in two main producing regions in Brazil: the northwestern Rio Grande do Sul and north Mato Grosso. The data correspond to cumulative monthly figures between October and April of the National Water Agency rain gauge network (ANA) in Brazil. The main results indicate annual variability different modes, especially in subtropical and temperate climates such as Rio Grande do Sul that have the observed rainfall lowest variability values indicating greater consistency between data and also a great relationship with soy annual data. In the Mato Grosso region, dominated by the tropical continental climate and also transitional climate, the variability is lower and the relation between annual rainfall and soybean production cannot be stated as simply.Le but de cet article est de comparer la variation récente de l'ensemble des précipitations des mois correspondant à la culture de soja entre 1998-1999 et 2012-2013 dans deux régions productrices au Brésil : le Nord-Ouest du Rio Grande do Sul et le Nord du Mato Grosso. Les données utilisées sont les totaux mensuels cumulés entre octobre et avril, obtenus auprès de l'Agence nationale de l'eau (ANA) du Brésil. Les principaux résultats indiquent différents modes de variabilité interannuelle, en particulier pour les climats subtropicaux et tempérés comme dans l'Etat de Rio Grande do Sul, qui présente la plus faible variabilité pluviométrique observée, ainsi qu'une bonne relation entre les pluies annuelles et les rendements de soja. Dans la région du Mato Grosso, où domine un climat tropical de type continental plus arrosé, la variabilité est moins homogène entre les stations pluviométriques et la relation entre pluies annuelles et rendements du soja ne peut être établie

Bayesian variable selection and survival modeling: assessing the Most important comorbidities that impact lung and colorectal cancer survival in Spain

ancer survival represents one of the main indicators of interest in cancer epidemiology. However, the survival of cancer patients can be affected by several factors, such as comorbidities, that may interact with the cancer biology. Moreover, it is interesting to understand how different cancer sites and tumour stages are affected by different comorbidities. Identifying the comorbidities that affect cancer survival is thus of interest as it can be used to identify factors driving the survival of cancer patients. This information can also be used to identify vulnerable groups of patients with comorbidities that may lead to worst prognosis of cancer. We address these questions and propose a principled selection and evaluation of the effect of comorbidities on the overall survival of cancer patients. In the first step, we apply a Bayesian variable selection method that can be used to identify the comorbidities that predict overall survival. In the second step, we build a general Bayesian survival model that accounts for time-varying effects. In the third step, we derive several posterior predictive measures to quantify the effect of individual comorbidities on the population overall survival. We present applications to data on lung and colorectal cancers from two Spanish population-based cancer registries. The proposed methodology is implemented with a combination of the R-packages mombf and rstan. We provide the code for reproducibility at https://github.com/migariane/BayesVarImpComorbiCancer

Estudo físico-químico da farinha de mandioca por análise de componentes principais.

O Território da cidadania do Vale do Juruá (TCVJ), no Acre, composto por cinco municípios: Cruzeiro do Sul, Mâncio Lima, Marechal Thaumaturgo, Porto Walter e Rodrigues Alves (MDA, 2011), é extremamente conhecido no Estado por sua produção de farinha de mandioca. A farinha é um alimento de alto valor energético, rico em amido e fibras, além de minerais como potássio, cálcio, fósforo, sódio e ferro (DIAS; LEONEL, 2006), baixo teor de proteína e elevado teor de carboidratos (FERREIRA NETO et al., 2003). Dessa forma, a determinação da qualidade físico-química da farinha do estado é indispensável, principalmente devido ao seu amplo consumo e processamento tipicamente artesanal. A análise de componentes principais se mostra como uma boa ferramenta para tal, reduzindo as dimensões dos conjuntos de dados e mantendo a maior variação original possível das variáveis (HAIR, et al. 2005), oferecendo uma análise otimizada e eficiente. Assim, o objetivo deste estudo foi identificar quais características físico-químicas que mais influenciam na qualidade da farinha de mandioca produzida no Território da Cidadania do Vale do Juruá, Acre, por meio da análise de componentes principais.Categoria Processamento e agroindústria: resumo 16